L'intero centro storico di Assisi è compreso nel Parco e ne caratterizza le valenze naturali e storico-culturali, tanto che l'Area Naturale Protetta potrebbe chiamarsi, indifferentemente, "Parco di Assisi".

Il Monte Subasio, sin dal X sec. a.C., ha assunto carattere di sacralità e misticismo per le popolazioni umbre, e questi elementi di spiritualità si sono rafforzati e caratterizzati con San Francesco e le presenze del suo ordine monastico. Il Cantico delle Creature è, infatti, uno straordinario documento di ammirazione e di amore per la natura e il Monte Subasio.

Nell'area del Parco si trovano, inoltre, borghi, rocche, ponti, fontane, chiese, monasteri, abbazie, oratori e santuari che accrescono il valore storico e architettonico dell'area. Il susseguirsi di tutte queste piccole ma importanti opere, inserite in un contesto dalla forte connotazione agricola e rurale, rappresenta una delle maggiori attrazioni turistiche dell'area.